Pokémon Ruby & Sapphire
Wilayah Hoenn yang bernuansa tropis dan dikelilingi lautan jadi latar generasi ketiga ini, dengan grafis yang jauh lebih detail berkat lompatan ke Game Boy Advance. Cerita utamanya berpusat pada konflik dua organisasi jahat, Team Aqua dan Team Magma, yang masing-masing berusaha membangunkan Pokemon legendaris Kyogre dan Groudon demi memperluas lautan atau daratan.
Ruby & Sapphire memperkenalkan fitur double battle (dua Pokemon bertarung sekaligus di tiap sisi), Pokemon Contest sebagai mode kompetisi non-bertarung, serta abilities — kemampuan pasif unik yang memengaruhi jalannya pertarungan, sebuah sistem yang terus dipakai di seluruh game setelahnya.
Generasi ini juga menjadi awal dari fitur natures (sifat) yang memengaruhi pertumbuhan statistik Pokemon, menambah lapisan strategi baru dalam membesarkan tim yang kompetitif.